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    已经确定为纳米级的未来生物分子计算机的应用功能是非常可观的，有关研究已经表明，生物分子计算机可将探测能力和生物医疗结合起来，将生物分子原件组装的计算机植入人体后，能自动扫描身体的信号、检测生理指标、诊断疾病，还可控制药物释放等，虽然现在还是一种愿景，但基本可以确立下来。分子计算机的愿景功能曾经在一种二态系统演示过，这种系统由DNA（脱氧核糖核酸）及一种限制酶制成，可以根据信使RNA的表达水平和变异探测疾病指标，只是每计算一步只可检测一种疾病指标。

    在后来进一步的研究中，已经拓展了计算机功能，可依据小分子RNA、蛋白质、小分子ATP等同时探测多种疾病的指标，而且已经简化了方法，检测的成分也更少了，敏锐度也提高了。能探测到多种疾病信号的组合，作用更大，诊断疾病的精确度更高，还能更好地比较疾病之间的差别，如甲状腺癌可探测到甲状腺球蛋白、降血钙激素的指标组合，对于确定疾病更加准确。

    如果研究进展顺利，未来生物分子计算机可在人体内漫游，及时提前发现疾病体征信号，还能进一步诊断疾病、激活药物分子进行治疗。也可以将分子计算机送入血管、植入某器官、某组织的细胞内，作预防护理。当然达到这样的目标，还有漫长的路要走。目前科学家们正在开发更简单、不需限制酶或者能依靠细胞自身运作的分子计算机。